RNA pada organisme eukariotik (Ribonucleic acid) ada banyak jenisnya dan tentu saja masing-masing jenis memiliki fungsi yang berbeda-beda dalam tiap tahapan sistem biologis organisme tersebut. Pada dasarnya, ada tiga kelas mayor RNA. Pertama, mRNA (messenger RNA), dan prekursornya, pre-mRNA atau hnRNA (heterogenous nuclear RNA), yaitu seutas RNA yang mengandung kodon atau mengkode protein tertentu dan merupakan transkrip dari DNA genomik melalui proses transkripsi. Sepuluh persen RNA dalam sel eukariot adalah RNA jenis ini.
Kedua, RNA yang tidak mengandung kodon atau membawa informasi genetis tapi memiliki peran penting secara langsung dalam tahapan-tahapan sintesis protein. Termasuk dalam jenis RNA ini adalah rRNA (ribosomal RNA), non-coding RNA yang merupakan bagian pembentuk ribosom sekaligus merupakan bagian aktif dalam ribosom sebagai ribozyme peptidyltransferase dan membentuk 75% total massa RNA dalam sel, tRNA (transfer RNA) yang berperan sebagai molekul adapter dalam proses translasi protein, dan snRNA (small nuclear RNA), yang berperan dalam pemrosesan hnRNA menjadi mRNA matur melalui proses splicing.

Pada ummnya stress merupakan suatu kondisi tertekan, bisa tertekan secara kejiwaan maupun tertekan secara fisik, misal pada beberapa atlet olah raga yang mengalami pelatihan berat. Stress juga merupakan suatu kondisi yang meyertai kehidupan manusia, tidak ada manusia hidup yang bebas dari segala macam stress. Dalam kadar yang tertentu, stress itu baik untuk melatih tubuh kita secara fisik dan mental agar menjadi lebih kuat dan teruji. Namun, jika stress itu berlebihan dan berkepanjangan, tentu saja akan membawa dampak yang buruk bagi kesehatan kita. Hal ini sudah merupakan pengetahuan umum yang ada di masyarakat, tetapi tidak banyak orang yang mengetahuinya mengapa stress dapat mempengaruhi keadaan-keadaan di atas dan apa akibatnya pada tingkat selular.

Saat kita stress oleh karena berbagai sebab, misal bekerja keras sepanjang hari, bertengkar, di PHK ataupun berhadapan dengan singa, pusat emosi kita dalam otak, akan mengantarkan pesan-pesan saraf (impuls) ke hipothalamus, yaitu suatu bagian dari pusat emosi kita yang terletak dibagian dasar dan tengah otak besar. Kemudian, hipothalamus akan mengolah impuls saraf tersebut, memproduksi dan melepaskan suatu zat yang disebut CRH (Corticothropin Releasing Hormone) kepada bagian otak lain yang berada dibawahnya, hipofisis atau pituitari. CRH selanjutnya akan merangsan hipofisis untuk melepaskan ACTH (Adrenocorticotropin Hormone) ke dalam sirkulasi darah.

Fungsi dan awal mula intron pada genom eukariotik sampai saat ini masih diperdebatkan, dan muncul berbagai macam teori, namun secara garis besar teori-teori tersebut dapat dibagi menjadi dua, yaitu teori yang menyatakan bahwa intron muncul pada makhluk hidup bersel satu pertama kali, teori ini lebih dikenal sebagai early introns. Seiring berevolusinya makhluk hidup, ada makhluk hidup yang terus mempertahankan keberadaan intron, seperti pada eukariot, dan ada makhluk hidup yang kehilangan intronnya, seperti pada prokariot. Sedangkan teori yang satunya lagi menyatakan bahwa intron muncul belakangan seiring evolusi makhluk hidup (late introns).

Seiring perkembangannya, teori early intron lebih banyak dianut oleh banyak ahli genetika evolusi sekarang karena memiliki sejumlah argumentasi yang dapat menjelaskan arti penting intron dalam memfasilitasi proses evolusi makhluk hidup. Pada dasarnya, bentuk-bentuk gen pada makhluk hidup yang ada sekarang berkembang dari bentuk awalnya (ancestral genes) melalui sejumlah proses duplikasi dan rekombinasi, kedua proses ini disebut juga genetic rearrangment. Contohnya, gen yang mengkode subunit hemoglobin, yaitu α dan β, serta gen yang mengkode myoglobin, diperkirakan memiliki bentuk awal yang sama, karena ketiganya memiliki jumlah ekson dan intron yang sama, demikian juga dengan panjang ekson dan intronnya yang mirip. Ketiganya memiliki 3 ekson dan 2 intron, di mana intron pertama lebih pendek daripada intron yang kedua. Sebagai perbandingan, bentuk awal dari gen-gen tersebut (ancestral genes) diwakilkan oleh gen analognya yang terdapat pada ragi (yeast). Ancestral genes inipun memiliki jumlah ekson dan intron yang sama serta memiliki konfigurasi yang sama.
Ancestral genes ini diperkirakan mengalami duplikasi untuk membentuk myoglobin dan subunit hemoglobin. Kemudian dalam perkembangan lebih lanjut, gen subunit hemoglobin mengalami duplikasi kembali menjadi subunit α dan β. Ketiga gen hasil duplikasi ini selanjutnya berevolusi sendiri-sendiri, mengalami mutasi, dan sejumlah rekombinasi. Akibatnya, urutan basa nitrogennya menjadi tidak 100% sama, namun masih menunjukkan tingkat kemiripan yang tinggi melalui analisis terhadap beberapa conserved sequence, yaitu suatu urutan basa nitrogen yang dipertahankan karena memiliki peran yang penting sehubungan dengan fungsi protein yang dikodenya, stabilitas mRNA yang dihasilkannya,  ataupun regulasi transkripsinya.
Contoh yang lain mengenai duplikasi DNA adalah duplikasi salah satu atau beberapa ekson pada suatu gen untuk menjadi bagian dari ekson gen lain. Sehingga dengan demikian, sebenarnya banyak gen yang ada sekarang memiliki bentuk-bentuk ancestral yang jumlahnya lebih sedikit. Dan antara gen yang satu dengan gen yang lain masih memiliki hubungan, baik karena berasal dari satu ancestral genes maupun karena mereka berbagi satu atau lebih ekson yang sama, karena ekson tersebut mengalami duplikasi selama evolusi. Gen-gen yang demikian disebut masih dalam satu famili jika tingkat kemiripian urutan basa nitrogen pada keseluruhan ekson dalam gen yang satu dengan gen yang lainnya itu mencapai 85% atau lebih. Selain contoh gen hemoglobin, masih banyak gen lain yang jelas mengalami duplikasi dan segment shuffling, misalkan gen-gen adhesive glycoprotein seperti fibronectin dan tenascin; membran channel seperti voltage gated sodium channel, CFTR (Cystic Fibrosis Transmembran Regulator), potasium channel, dll; dan beberapa gen extracellular matrix seperti kolagen, dan elastin.

Genetic rearrangement tidak hanya terjadi pada tingkat DNA, tapi juga pada tingkat RNA melalui sejumlah proses alternative splicing, dimana masing-masing ekson dalam untas hnRNA dapat “dipilih” untuk digunakan atau tidak tergantung kondisi yang mempengaruhi diekspresikannya gen tersebut. Keseluruhan proses ini memerlukan suatu mekanisme yang berfungsi mempertahankan integritas suatu gen atau unit-unit penyusunnya, yaitu ekson, agar suatu produk yang dikodenya tetap memiliki fungsi yang utuh. Jika suatu gen tidak memiliki intron, maka proses “utak-atik” gen seiring dengan perkembangan evolusi makhluk hidup harus dilakukan dengan tingkat akurasi yang sangat tinggi. Oleh karena urutan-urutan basa nitrogen dalam DNA tanpa intron, semuanya memiliki arti untuk mengkode suatu modul dalam protein dan memiliki fungsi tersendiri, apabila proses rearrangment dilakukan tanpa akurasi yang tinggi maka akan memotong informasi-informasi penting di dalamnya, akhirnya protein yang dihasilkan menjadi tidak berguna. Kendala ini dapat diatasi jika di sela-sela informasi atau kode genetik tersebut terdapat “ruang” yang dapat dipotong di banyak tempat tanpa merubah fungsi protein yang disandinya. Proses ini tidak memerlukan presisi yang tinggi dan memungkinkan proses genetic rearrangement berlangsung seiring dengan proses adaptasi makhluk hidup dalam berevolusi. Ruang antar ekson yang dimaksud di sini adalah intron.

Akan tetapi, walaupun teori early intron ini lebih banyak dianut, ada beberapa macam “blind spot” yang lebih cocok dijelaskan dengan teori late intron. Teori early intron yang memudahkan organisme berevolusi melalui proses segment shuffling hanya berlaku untuk organisme multiseluler yang memiliki tekanan seleksi alam dan tantangan kompetisi dalam lingkungan yang lebih rendah dibandingkan dengan mikroorganisme. Mikroorganisme cenderung berkembang biak cepat, berusaha bersaing atau berkompetisi dengan spesies lain dalam merebutkan sumber daya yang ada. Dalam kondisi seperti ini, tentu saja kemampuan berkembang biak yang cepat, genom yang lebih kecil, komponen regulator yang lebih sedikit jauh lebih menguntungkan dibandingkan genom yang lebih kompleks -ingatlah bahwa proses replikasi DNA saat mikroorganisme bereproduksi memerlukan energi, jadi, semakin pendek genom maka semakin cepat dan sedikit energi yang diperlukan.

Ketika Anda memeriksa genom dari berbagai maca spesies, Anda pasti mengira bahwa organisme yang sederhana memiliki genom yang yang lebih kecil daripada organisme yang lebih kompleks. Sebab, Anda mengasumsikan bahwa organisme yang lebih sederhana memerlukan sedikit gen daripada organisme yang lebih kompleks. Asumsi ini memang benar, tapi perkiraan bahwa organisme yang lebih sederhana memiliki genom yang lebih kecil tidaklah sesuai faktanya.

Ambilah contoh perbandingan antara manusia dan amoeba. Manusia sudah tentu memiliki lebih banyak gen daripada amoeba, sebab manusia adalah organisme multiselular yang jauh lebih kompleks daripada amoeba. Hal ini benar adanya, tapi apakah manusia juga memiliki genom yang lebih besar daripada amoeba?Tidak. Faktanya, manusia memiliki 3,3 milyar pasang basa dalam genomnya, sedangkan amoeba memiliki 200 milyar genom dalam genomnya, yaitu hampir 70 kali lebih banyak daripada manusia! Lantas mengapa genom organisme yang jauh lebih sederhana memiliki genom yang demikian besarnya?
Demikian juga contoh lain, yaitu bony fish dan japanese puffer fish, kedua jenis ikan ini merupakan spesies yang masih memiliki kekerabatan dekat.  Japanese puffer fish memiliki 0,5 milyar pasang basa dalam genomnya sedangkan bony fish memiliki 300 milyar pasang basa dalam genomnya, 600 kali lebih banyak daripada bony fish! Kenapa hal ini bisa terjadi? Apa yang gunanya kelebihan DNA dalam genom organisme-organisme tersebut?

Fenomena ini disebut sebagai C-Value Paradox, dengan C mengacu pada kuantitas DNA dalam genom organisme. Kelebihan DNA tersebut tidak mencerminkan komplektisitas komponen genetiknya, tapi hanya berupa DNA yang tidak memiliki fungsi ataupun mengkode suatu produk fungsional dalam organisme bersangkutan. Sebagian besar dari DNA tersebut merupakan suatu segmen repetitif yang terdiri dari transposons dan retrotransposons. Transposons atau disebut juga transposable elements merupakan segmen DNA yang bisa menginsersikan dirinya dimanapun dalam genom baik dengan cara mengkopi dirinya sendiri melalui replicative transposition atau mengkatalisis pemindahan segmen dirinya sendiri melalui mekanisme conservative transposition. Kedua mekanisme ini dilakukan oleh transposon menggunakan enzim transposase yang dikodenya dan tanpa melalui fase RNA. Sedangkan retrotransposon atau retrotransposable elements melakukan perpindahan atau insersi melalui fase RNA. Jadi transkrip dirinya selain mengkode reverse trankriptase, ia juga berfungsi sebagai template untuk membentuk cDNA untuk kemudian diinsersikan di tempat-tempat tertentu dalam genom.

Dalam tubuh manusia, terdapat dua jenis retrotransposon, yaitu SINEs (Short Interspersed Nuclear Elements) dan LINEs (Long Interspersed Nuclear Elements). LINEs memiliki panjang antara 1-6 Kbp sedangkan SINEs memiliki panjang 100 bp-1 kbp. LINEs, SINEs serta transposon lainnya menyusun 45% total genom kita! Dua puluh persen total genom merupakan LINEs dan 13% total genom adalah SINEs. Salah satu jenis LINEs yang disebut dngan segmen L1 terdapat dalam intron 79% gen manusia. Segmen-segmen DNA ini sering disebut juga sebagai junk DNA. Sebab ia tidak memiliki fungsi apa-apa selain “berkehendak” untuk mengkopi dirinya sebanyak mungkin agar tetap sintas.

Jadi, perbedaan besar genom tiap organisme tidak mencerminkan perbedaan komplektisitas genetiknya, namun lebih kepada perbedaan kemampuan tiap organisme untuk membuang atau menekan tranposisi dari berbagaimacam junk DNA di atas dan segmen DNA repetitif lainnya. Atau mungkin saja bahwa segmen DNA repetitif ini sebenarnya memiliki fungsi tertentu dalam genom yang belum bisa kita deteksi saat ini.

reference :
Hyde, D. 2009. DNA Structure and Chromosome Organization. In: Hyde, D. (Ed), Introduction to Genetics Principles, 1st Edition, (p. 166-181). New York: McGraw-Hill.
Pollard, T.D.; Earnshaw, W.C. & Lippincot-Schwartz, J. 2008. Chromosome Organization. In: Pollard, T.D. ; Earnshaw, W.C. & Lippincot-Schwartz,  J. (Eds), Cell Biology, 2nd Edition, (p. 193-208). Philadelphia: Saunders-Elsevier.
Young, I.D. 2005. Gene Structure and Function. In:  I.D. Young (Ed), Medical Genetics, 1st Edition, (p. 1-23). New York: Oxford University Press, Inc.

■ Keep regular sleep habits. Try to get to bed at the same time
and get up at the same time every day – even on weekends
and vacations.
■ Avoid caffeine and alcohol in the late afternoon and evening.
If consumed too close to bedtime, the caffeine in coffee, soft
drinks, chocolate, and some medications can keep you from
sleeping or sleeping soundly. Even though it can make you feel
sleepy, drinking alcohol around bedtime also can disturb sleep.
■ Time your exercise. Regular daytime exercise can improve
nighttime sleep. But avoid exercising within 3 hours of
bedtime, which actually can be stimulating, keeping you
awake.
■ Avoid daytime naps. Sleeping in the afternoon can interfere
with nighttime sleep. If you feel you can’t get by without a
nap, set an alarm for 1 hour. When it goes off, get up and start
moving.
■ Reserve your bed for sleeping. Watching the late news, reading
a suspense novel, or working on your laptop in bed can
stimulate you, making it hard to sleep.
■ Keep your bedroom dark, quiet, and cool.
■ Avoid liquids and spicy meals before bed. Heartburn and latenight
trips to the bathroom are not conducive to good sleep.
■ Wind down before bed. Avoid working right up to bedtime.
Do relaxing activities, such as listening to soft music or taking
a warm bath, that get you ready to sleep. (An added benefit of
the warm bath: It may soothe aching muscles.)

Remember to get in to your bedroom only when you want to sleep. And get out from your bedroom everytime you wake up more than 20 minutes. It will help your unrealized preception of bedroom as a place to sleep..and have a nice dream..

Untuk teman-teman yang mengalami kesulitan dalam melakukan penelitian, baik yang menempuh s2 ataupun s3, mengalami kesulitan dalam mencari informasi, sumber kepustakaan, contact person antar ilmuwan, saya bisa memediasi dan memberikan sumber kepustakaan, gratis..cukup ganti biaya kirim, kalau memang perlu dikirmkan..